Pacientes com doença valvular ou alguma forma de doença cardíaca congênita apresentam uma situação de esforço excessivo que é particularmente suscetível aos efeitos do aumento do exercício e da transferência de sangue para o coração e os pulmões devido à imersão em água.

A presença de uma anormalidade por si só não é uma contra-indicação ao mergulho. No caso de shunts intracardíacos por orifícios nas paredes e na presença de estreitamento ou alargamento significativo da válvula no interior do coração, o mergulho é contra-indicado.